Der CDU-Stadtverband Warburg wurde im Jahr 1975 zeitgleich mit der kommunalen Neugliederung im Altkreis Warburg gegründet. Er ist der Dachverband der 14 CDU-Ortsverbände und der CDU-nahen Vereinigungen (Frauen-Union, Senioren-Union, Mittelstandsvereinigung, Junge Union) im Stadtgebiet Warburg.
Der CDU-Stadtverband Warburg hat derzeit ca. 450 Mitglieder. Damit ist er der mitgliederstärkste Verband unter den zehn Stadtverbänden des CDU-Kreisverbandes Höxter.
Der Stadtverband wird durch einen Vorstand geführt, der sich aus gewählten und kooptierten Mitgliedern zusammensetzt.
Die administrativen Aufgaben des CDU-Stadtverbandes (Mitgliederverwaltung, Bürodienstleistungen usw.) werden durch die CDU-Kreisgeschäftsstelle in Höxter erledigt.